Алексей Александрович родился 19 октября 1972 года в Москве.
В структуре Департамента культурного наследия города Москвы работает с 21 сентября 1990 года.
В 1996 году Алексей Емельянов закончил Московский институт коммунального хозяйства и строительства. Инженер-градостроитель, кандидат технических наук.
С 1996 года активно развивал направление формирования и использования информационных ресурсов государственного учета объектов культурного наследия, включая тематику сохранения историко-градостроительной среды, по которой в 2004 году была защищена кандидатская диссертация.
При участии Алексея Александровича в 2006-2007 годах впервые в Российской Федерации были введены в эксплуатацию городские автоматизированные информационные системы — Городской реестр недвижимого культурного наследия и Историко-культурный опорный план города Москвы.
С 2008 года Алексей Александрович организовал плановую разработку более 2500 предметов охраны объектов культурного наследия и их последующее утверждение, что позволило обеспечить предметами охраны все объекты, находящиеся в собственности города Москвы.
В период с 2009 по 2011 гг. инициировал разработку и утверждение в установленном порядке границ более 1500 территорий объектов культурного наследия, что впервые позволило утвердить территории всех объектов культурного наследия, расположенных в границах города Москвы.
С 2010 по 2013 гг. Алексей Емельянов обеспечивал проведение государственной историко-культурной экспертизы на более 1200 объектах, обладающих признаками объекта культурного наследия.
С 2011 года обеспечил принятие Правительством Москвы более 40 нормативных актов об установлении зон охраны, режимов использования земель и градостроительных регламентов в границах зон охраны объектов культурного наследия.
При личном участии Алексея Александровича обеспечено принятие решений Правительства Москвы о постановке под государственную охрану более 800 объектов культурного наследия регионального значения.
С 2011 года Алексей Емельянов является председателем рабочей группы Комиссии при Правительстве Москвы по рассмотрению вопросов осуществления градостроительной деятельности в границах достопримечательных мест и зон охраны объектов культурного наследия.
За время работы Комиссии приняты решения о включении в Реестр недвижимого культурного наследия 95 новых объектов культурного наследия, о сохранении ранее планировавшихся к сносу 196 строений, играющих важную роль в сохранении исторического облика города Москвы и об утверждении 41 проектов режимов использования земель и градостроительных регламентов.
27 июня 2015 г. назначен на должность руководителя Департамента культурного наследия города Москвы.
21 сентября 2018 г. назначен на должность руководителя Департамента культурного наследия города Москвы.
Хобби: Спорт. Любимые места в Москве: Чистопрудный бульвар, усадьба «Кузьминки».
Присвоен классный чин государственный советник города Москвы 1-го класса.
